生态系统多样性泛指在不同类型的生态系统中所包含的生物多样性。生态系统多样性是指在地球上所有的生态系统中，不同的生态系统类型和不同的生态过程所表现的多样性。生态系统多样性是我们与地球上其他生物之间共存的基础。随着人口的增长以及资源的不断开发，人类已经对地球上的生态系统造成了很大的破坏，这也使得生态系统多样性的保护变得尤为重要。
生态系统多样性的重要性在于它使地球上的生命得以持续繁衍。没有生态系统的存在，人类的生存也将变得很困难，同时它还对人类健康、食品供应、经济以及文化等各方面都有着很大的影响。比如，保持森林生态系统的多样性和健康状态对减缓气候变化是至关重要的，而许多植物和药品的重要来源也在于维持生态系统多样性。
